Дмитрий Пензар (ИОГен , ФББ) «Машинное обучение для предсказания эффектов однонуклеотидных мутаций»

🚀 @SBERLOGABIG online seminar on bioinformatics: 👨‍🔬 Дмитрий Пензар (ИОГен , ФББ) «Машинное обучение для предсказания эффектов однонуклеотидных мутаций» ⌚️ Пятница 11 марта, по Москве Однонуклеотидные мутации в регуляторных районах генома (rSNV) могут затрагивать разные стадии экспрессии, включая транскрипцию, сплайсинг и трансляцию. Нахождение таких вариантов и описание их механизма действия представляется одной из важных задач современной медицинской геномики и персонифицированной медицины. Количество экспериментальных данных, которые могут быть использованы для данной задачи, стремительно растет, однако это все равно не позволяет решать ее достаточно эффективно. В данном докладе я расскажу о современных методах машинного обучения, пытающихся решить данную задачу. Мы поговорим о классических методах, представителем которых является deltaSVM, до сих пор остающийся SOTA по результатам открытых соревнований. Будут разобраны и методы, основанные на глубоком обучении – сравнительно старом подходе, ос