Исаев С.В. - Анализ транскриптомных данных - Лекция 14. Определение типов клеток в scRNA-Seq
Определение типов клеток в scRNA-Seq: автоматическое и мануальное.
00:02:35 Типы иммунных клеток
00:08:34 Мануальные подходы к аннотации
00:21:00 Поиск маркеров. AUC ROC
00:40:11 Дифференциальная экспрессия
00:47:34 Тест Манна-Уитни и AUC
00:50:53 Проблемы с маркерными генами
00:58:48 Автоматическое определение типов клеток: Single R, Label transfer
01:13:20 Определение раковых клеток с помощью InterCVN
Ссылка на плейлист: