Разбор алгоритмов и идей DeepMind AlphaFold2 с позиции ML-инженерии - Boris Burkov
Целеполагание ключевых модулей системы, а также ряд инженерных приемов:
- Исходные данные и общий поток информации в системе: выравнивания, hmmer, uniprot/mgnify/BFD, pdb, шаблоны структур.
- Архитектура нейросетевой части с высоты птичьего полета: Evoformer и структурный модуль.
- Evoformer: дистограммы из выравнивания через внешнее произведение и gated self-attention, условная оптимизация и соблюдения неравенств треугольника с помощью triangle self-attention
- Структурный модуль: механика постепенного сворачивания белка, Invariant Point Attention (IPA), SE(3)-эквивариантность
- Frame Aligned Point Error (FAPE) и дополнительные лоссы
- recylcing и самодистилляция
📈 Слайды
📢 Подписывайся на наше сообщество в telegram, чтобы быть в курсе мероприятий
🗨 Обсудить доклады можно в нашем чатике
I believe that DeepMind AlphaFold2 and Github Co-pilot were among the most prolific advances of technology made in 2021. Two years after their initial breakthrough, DeepMind released the second version of their revolutionary system for protein 3D structure prediction. This time they basically solved the 3D structure prediction problem that held for more than 50 years. These are the notes from my detailed talk on the DeepMind AlphaFold2 system.
You can turn on english subtitles here
1 view
90
20
2 weeks ago 02:18:30 1
Елена Филиппова. Русские Руны Рунические формулы и работа с ними[2024-05-22]
2 weeks ago 02:42:22 1
Анемии 2023
2 weeks ago 00:13:38 1
КАК ПРАВИЛЬНО ЗАРЯЖАТЬ СМАРТФОНЫ?
2 weeks ago 00:06:49 1
ЕГЭ Химия. Практикум решения задач “Обратимые и необратимые реакции“ по теме «Химическая кинетика»
2 weeks ago 05:08:42 1
Тригонометрия с НУЛЯ до Уровня ЕГЭ за 3 часа. Задание 13, 6, 7. Уравнения из 2 части!
2 weeks ago 01:27:30 1
Закупки в Китае. Эфир с импортерами 18 ноября 2020
2 weeks ago 00:36:52 1
КВАДРАТ ПИФАГОРА - анализ характера и способностей по дате рождения. Нумерология
2 weeks ago 00:18:42 1
Разбор 6 задания | ОГЭ по информатике 2023
2 weeks ago 00:17:14 1
Разбор 5 задания | ОГЭ по информатике 2023
2 weeks ago 00:11:13 1
Информатика 8 класс (Урок№11 - Анализ алгоритмов.)
2 weeks ago 00:18:33 5
Получение звука гитар Slipknot с помощью PositiveGrid BIAS и функции Amp Match
2 weeks ago 00:01:24 1
Как гипнотизеры будут учиться гипнозу? Промо с курса по классическому гипнозу
2 weeks ago 02:26:20 1
ЭКСПРЕСС-ПРАКТИКА ПО СОЧЕТАНИЯМ И ТРИПЛЕТАМ ТАРО!
2 weeks ago 00:18:47 2
Сложный пациент для профессора Васильевой
2 weeks ago 01:15:46 1
Клинический разбор больного с симптоматической гипертонией.
2 weeks ago 03:45:07 1
Как самые древние программы влияют на нас сегодня? Эфир с нейрофизиологом Марией Свет
3 weeks ago 00:32:43 1
Таро Манара. Значение карт. 1. Аркан Маг
3 weeks ago 00:02:34 1
2. Неполная разборка АК
3 weeks ago 02:18:10 1
Как косметологу составлять планы ведения пациентов: разбор ошибок и алгоритмы. г.
3 weeks ago 00:03:41 1
КОНСТИТУЦИЯ или ОБЩЕСТВЕННЫЙ ДОГОВОР 🙄 и многое дррр
3 weeks ago 00:07:16 1
Боль в шее и между лопаток | Трапециевидная мышца
3 weeks ago 01:15:01 1
Частичная переделка электрики в квартире
3 weeks ago 00:21:33 1
ВНЧС. Височный нижнечелюстной сустав. Полный разбор.
3 weeks ago 00:05:40 1
Задание 6. ЕГЭ Информатика 2024. Новый разбор за 6 минут! КУМИР черепаха