Озеро Сон-Куль расположено в самом сердце Внутреннего Тянь-Шаня в 90 км к северо-западу от г. Нарына. Котловина длиной 57 км и шириной 29 км располагается внутри мощных горных нагромождений. В центре этой котловины раскинулось второе по величине озеро Кыргызстана - Сон- Куль. Оно имеет длину 29 км и ширину 17 км. Поверхность его находится на высоте 3016 м над уровнем моря, площадь зеркала 270 кв. км, максимальная глубина 13.2 м. Озеро тектонического происхождения, заполнено пресной водой.
В озеро впадают 18 ручьев, а вытекает только единственная река Сон-Куль. Только 4 речки имеют постоянный сток в озеро: Кум-Бель, Ак-Таш, Таш-Тебе и Кара-Кече. Прибрежная полоса имеет различный характер: Северо-западная часть изрезана скалистыми бухтами и заливами, а остальная имеет пологие берега с отдельными заболоченными участками. В долине реки - Сон- Куль. имеется множество термокарстовых воронок, которые образовались в результате протаивания вечной мерзлоты, расположенной на глубине 1,5 м. В 4-х км от истока водн